7月19日下午,受学院陈兴教授邀请,浙江大学蒋杭进教授、浙江工业大学张贵军教授、广西大学钟诚教授在钱伟长楼201报告厅分别作了题为“可解释机器学习算法及其在生命健康中的应用”、“蛋白质复合物结构与动态构象预测”和“机器学习和深度学习驱动的生物信息计算研究初探”三场专题学术报告。本次活动由陈兴教授主持,学院部分教师与研究生到场参与交流。
讲座伊始,陈兴教授对三位专家的莅临致以热烈欢迎与诚挚谢意。他指出,人工智能与生命科学的深度融合正持续催生全新研究范式,可解释机器学习、蛋白质结构预测及智能生物信息计算等方向,已成为当前生物信息学领域的核心研究热点。本次系列学术报告聚焦学科前沿,期待通过专家分享最新研究成果与学术思考,进一步营造浓厚学术氛围,助力生物信息学相关团队科研创新能力提升。
报告会上,蒋杭进教授围绕可解释机器学习算法在生命健康领域中的应用展开介绍。蒋教授首先介绍了课题组面向生物医学大数据特征筛选提出的深度学习方法,该方法利用卷积神经网络、重要性映射网络与掩码机制,实现了关键变量的自动筛选。随后展示了该方法在多个生命科学问题中的应用,指出该方法能够发现传统差异表达分析难以识别的重要生物学特征,为生命健康领域的数据分析提供了全新的思路。
张贵军教授聚焦蛋白质复合物结构预测与动态构象预测,介绍了课题组近年来取得的研究进展。张教授首先回顾了AlphaFold系列模型的发展历程,指出当下蛋白质结构研究正从静态结构预测向动态构象模拟延伸,重点介绍了团队在蛋白质复合物建模、模型质量评估等方向的成果,以及利用人工智能方法探索蛋白质动态构象变化、挖掘隐藏结合位点的最新进展,强调未来蛋白质结构研究需进一步结合实验数据,实现静态结构预测与动态过程模拟的深度融合。
钟诚教授分享了团队在机器学习与深度学习驱动生物信息计算方向的系列研究,覆盖药物-靶点关联预测、化合物-蛋白质相互作用预测、非编码RNA与疾病关联预测、植物抗性蛋白预测等多个场景。他结合自身科研经历指出,生物信息学是高度交叉的学科,需将数据构建、算法设计与实验验证有机结合,同时积极借鉴网络分析、推荐系统、图计算等领域的方法,共同推动生命科学研究向前发展。
报告结束后,三位教授与现场师生展开深入交流,围绕人工智能算法、生物信息计算、生命健康前沿研究等议题展开热烈研讨,细致解答师生提出的各类问题。本次学术报告内容扎实、前沿性突出,既拓宽了在场师生的学术视野,也进一步推动了人工智能与生命健康交叉领域的学术互动,为学院相关学科的建设发展提供了新的思路与启发。
嘉宾介绍:
蒋杭进,香港中文大学统计学博士(导师:樊晓丹教授), 曾访问斯坦福大学统计系Wing Hung Wong (王永雄)院士。现任浙江大学数据科学研究中心研究员(长聘副教授、博导),浙江大学医学院附属邵逸夫医院兼职教授,浙江省生物信息学学会理事、副秘书长,国际计算生物学学会中国理事会理事,中国抗癌学会基因诊断委员会委员,浙江省高层次青年人才(生命健康领域),教育部生物科学"101计划"生物信息学核心教材建设专家,主要研究可解释机器学习算法及其在生命科学中的应用,在Science Advances, Nature Communications, Nature Plants, Nature Genetics, Patterns (Cell 子刊), Science Bulletin, Advanced Science, Communications biology 等高水平期刊上发表论文40余篇。主持或参与多项国家自然科学基金项目,浙江省重大研发计划,中国烟草总公司重大科技计划和国家基金委重点项目。
张贵军,浙江工业大学健行特聘教授,博士,博士生导师。浙江省生物信息学学会常务理事、秘书长,浙江省生物信息学学会人工智能专委会主任,中国生物信息学学会(筹)生物分子结构预测与模拟专业委员会常务委员,中国自动化学会智能健康与生物信息专业委员会委员。研究领域为结构生物信息学、人工智能及计算智能,围绕蛋白质折叠路径、结构预测、复合物组装、模型质量评估及序列设计等方向开展研究工作,相关成果在PNAS, Nat. Mach. Intell., Nat. Struct. Mol. Biol., Nat. Commun., Nat. Comput. Sci., Nat. Protoc., Genome Biol., Nucleic Acids Res.等国内外期刊上发表学术论文150篇,授权国家发明专利50余项,实施专利转化14项。连续两届受邀参加CASP会议并作专题报告。主持科技部科技创新2030—“新一代人工智能”重大项目课题(2项)、国家自然科学基金面上项目(4项)、浙江省自然科学基金重点及企业合作等项目20多项。获中国自动化学会自然科学二等奖1项(排名第一)。
钟诚,广西大学二级教授、博士生导师。现担任国家高性能计算中心南宁分中心主任、广西智能数字服务工程技术创新中心副主任。曾担任广西大学计算机与电子信息学院党委书记、院长和广西大学研究生院副院长等职务。中国网络空间安全学会理事。中国计算机学会杰出会员。中国人工智能学会教育工作委员会委员。广西计算机学会副理事长。中文核心期刊、CSCD核心期刊《计算机科学与探索》、《小型微型计算机系统》编委,中文核心期刊、CSCD核心期刊《基因组学与应用生物学》副主编,中文核心期刊《广西大学学报(自然科学版)》专题主编。中国科学家精神宣讲团成员。首批广西科学家精神宣讲团成员。主持国家自然科学基金、国家外国专家局、广西自然科学基金、广西科学研究与技术开发计划、香港王宽诚教育基金会等立项支持的科研项目10多项;发表高质量研究论文100多篇;主编出版教材5部,其中2部教材入选普通高等教育国家级规划本科教材。曾获广西区直属机关基层理论宣讲优秀个人、国家级一流本科课程、广西高等学校教学成果奖、广西高校科技进步奖、广西高等学校优秀教材奖、广西计算机成果奖等奖励。

蒋杭进教授作报告

张贵军教授作报告

钟诚教授作报告

陈兴教授致欢迎辞