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高洁

王健发布日期:2023-10-10点击:

职称 教授 研究方向 计算系统生物学,生物信息学,生物统计学等
邮箱 gaojie@jiangnan.edu.cn

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高洁


性别:

出生日期:1972.8

职称、职务:教授

电话(手机):

E-mailgaojie@jiangnan.edu.cn

综合简介】

高洁,中共党员,江南大学数学与数据科学学院教授、博士生导师。“十四五”江苏省重点学科数学)带头人校学术委员会委员。兼任中国工业与应用数学学会数学生命科学专委会理事、中国运筹学会计算系统生物学分会理事、江苏省数学学会常务理事、江苏省概率统计学会副理事长等职。

教学方面,曾获得江苏省研究生教改课题一项,主讲在线课程上线国家高等教育智慧教育平台研究生教育板块,作为课程负责人评江苏省研究生优秀教学资源(课程)一项,作为第一完成人获全国素质教育教研成果一等奖一项,江南大学本科教学成果一、二等奖各一江南大学研究生教学成果等奖一项。

科研方面,长期从事应用数学、概率统计、计算生物学及其相关的教学和科研工作,在Communications BiologyBioinformatics数学与计算生物学领域权威期刊发表SCI论文60多篇,曾获得国家自然科学基金面上项目、重点项目课题、重大研究计划课题、教育部基本科研面上项目等。

【工作及研究经历】:

1994.8至今,江南大学工作;

2013.9-2016.6,中科院上海生命科学院系统生物学重点实验室,博士后

2006.3-2009.6,江南大学信息工程学院,博士;

2000.9-2003.6,南京大学数学系,硕士;

1990.9-1994.6,南京师范大学数学系,学士。

【研究领域】

计算系统生物学,生物信息学,生物统计学等

【主要论著】(著作和论文)

主要论文::

[1] Qi G, Wang L, Nan M, Fu Y, Ren Q, Zhang Y, Sun Z, Shi Z, Lu J, Gao J*. scXDR: Drug response prediction across single-cell datasets via heterogeneous network transfer learning. Communications Biology, 2026, 9: 139.

[2] Shi Z, Sun Z, Zhang Y, Qi G, Gao J*. COVARE for modeling latent random effect correlations to detect genes with specific spatial expression patterns. Genomics, 2026, 118: 111242.

[3] Qi G, Wang L, Chen X, Shi Y, Ma Y, Ren Q, Fu Y, Nan M, Gao J*. scHDR: A heterogeneous network transfer predicting single-cell drug responses. Current Bioinformatics, 2026, doi: 10.2174/ 01157489364012912 51010055212.

[4] Lu J, Jiang Y, Fu Y, Nan M, Ren Q, Gao J*. MFCN-DDI: Capsule network based on multimodal feature for multitype drug–drug interaction prediction. Quantitative Biology, 2026, 14(1): e70021.

[5] Fu Y, Nan M, Ren Q, Chen X, Gao J*. A multi-view graph convolutional network framework based on adaptive adjacency matrix and multi-strategy fusion mechanism for identifying spatial domains. Bioinformatics, 2025, 41(4): btaf172.

[6] Zhang B, Nan M, Wang L, Wu H, Chen X, Shi Y, Ma Y, Gao J*. JSNMFuP: A unsupervised method for the integrative analysis of single-cell multi-omics data based on non-negative matrix factorization, BMC Genomics, 2025, 26: 274.

[7] Nan M, Ren Q, Fu Y, Chen X, Qi G, Wang L, Gao J*. LONMF: A non-negative matrix factorization model based on graph Laplacian and optimal transmission for Paired single-cell multi-omics data integration. BMC Bioinformatics, 2025, 26: 294.

[8] Chen X, Ma Y, Shi Y, Zhang B, Wu H, Gao J*. Fuzzy-based identification of transition cells to infer cell trajectory for single-cell transcriptomics. Journal of Computational Biology, 2025, 32(3): 253-273.

[9] Wang L, Zhang B, Wu H, Shi Y, Chen X, Ma Y, Gao J*. Microbe-drug association prediction model based on adaptive network fusion of structural topological information with integration strategy. IEEE Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2025, 22(4): 1481-1493.

[10] Wang L, Qi G, Shi Y, Ma Y, Gao J*. A systematic longitudinal study of microbiome: integrating temporal-spatial dimensions with causal and deep learning models. BMC Genomics, 2025, 26: 1068.

[11] Ren Q, Nan M, Fu Y, Chen X, Ma Y, Shi Y, Gao J*. SCSAGRN: Inferring gene regulatory networks from single-cell multi-omics using spatial association. BioSystems, 2025, 254: 105531.

[12] Chen X, Ma Y, Shi Y, Fu Y, Nan M, Ren Q, Gao J*. Population-level cell trajectory inference based on Gaussian Distributions. Biomolecules, 2024, 14: 1396.

[13] Shi Y, Ma Y, Chen X, Gao J*. scADCA: An anomaly detection-based scRNA-seq dataset cell type annotation method for identifying novel cells. Current Bioinformatics, 2024, 20(10): 904-917.

[14] Zhang B, Wu H, Wang Y, Xuan C, Gao J*. scGAMNN: Graph antoencoder-based single-cell RNA sequencing data integration algorithm using mutual nearest neighbors. IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 2023, 27(11): 5665-5674.

[15] Wang Y, Xuan C, Wu H, Zhang B, Ding T, Gao J*. p-CSN: Single-cell RNA sequencing data analysis by partial cell-specific network. Briefings in Bioinformatics, 2023, 24(3): bbad180.

[16] Wang L, Wang Y, Xuan C, Zhang B, Wu H, Gao J*. Predicting potential

microbe-disease associations based on multi source features and deep learning. Briefings in Bioinformatics, 2023, 24(4): bbad255.

[17] Zhou G, Xuan C, Wang Y, Zhang B, Wu H, Gao J*. Drug repositioning based on a multiplex network by integrating disease, gene, and drug information. Current Bioinformatics, 2023, 18(3): 266-275.

[18] Wang Y, Gao J*, Xuan C, Guan T, Zhou G, Wang Y, Ding T. FSCAM: CAM-based feature selection for clustering scRNA-seq. Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 2022, 14(2): 394-408.

[19] Wang Y, Zhou G, Guan T, Wang Y, Xuan C, Ding T, Gao J*. A network-based matrix factorization framework for ceRNA co-modules recognition of cancer genomic data. Briefings in Bioinformatics, 2022, 23(5): bbac154.

[20] Yujie Wang, Tianhao Guan, Gang Zhou, Hongqian Zhao and Jie Gao*. SOJNMF: Identifying multidimensional molecular regulatory modules by sparse orthogonality-regularized joint non-negative matrix factorization algorithm. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2022, 19(6): 3695-3703.

主要著作:

[1] 高洁著,基于时间序列理论方法的生物序列特征分析,金琅学术出版社,2016.

[2] 曹菊生,魏国强,方正,高洁编,概率统计与数据处理,苏州大学出版社,2011.江苏省高等学校立项精品教材

[3] 吴有炜,高洁主编,概率论与数理统计,苏州大学出版社,2004. (江南大学优秀教材)

【科研、教学项目】

科研项目:

1. 国家自然科学基金面上项目,单细胞多组学数据分析方法研究及应用,2023/01-2026/12,主持,在研。

2. 国家自然科学基金重点项目课题,癌症演变的高维组学数据分析与多尺度随机动力学建模,2019/01-2023/12,主持,结题

3. 国家自然科学基金重大研究计划课题,干细胞增殖的计算建模及其在癌症演变动力学的应用,2018/01-2019/12,主持,结题。

4. 教育部基本科研面上项目,人类流感病毒种属和亚型预测的模型分析,2011/01-2012/12,主持,结题。

5. 国家自然科学基金重大研究计划,基于人工智能方法的蛋白质-配体相互作用预测研究,2024/01-2026/12,主要参与,在研

6. 国家自然科学基金数学天元基金项目第一届魅丽数学与交叉应用会议,2024/01-2024/12,主要参与,结题。

7. 国家自然科学基金面上项目,P53抑癌基因分子调控机制的数学建模及其算法研究,2013/01-2016/12,主要参与,结题。

8. 国家自然科学基金面上项目,基于消费者偏好的可追溯食品消费政策的多重模拟实验研究,2013/01-2016/12,主要参与,结题。

教学项目:

1. 试验设计与数据处理教学案例库,江南大学研究生教学案例库建设项目,2024.12-2026.12,主持,在研

2. 试验设计与数据处理,江南大学研究生课程思政示范课程,2023.4-2024.4,主持,结题。

3. 试验设计与数据处理,江南大学研究生在线课程建设项目,2021.12-2023.12,主持,结题。

4. “试验设计与数据处理”课程教学改革研究,江苏省研究生教育教学改革研究与实践课题,2014.1-2015.12,主持,结题。

5. “试验设计与数据处理”课程教学改革研究,江南大学质量工程建设项目,2014.1-2015.12,主持,结题。

6. 金融数学的本科教学研究,江南大学质量工程建设项目,2009.1-2010.12,主持,结题。

7. 《数学建模》精品课程,江苏省精品课程建设项目,2009.1-2010.12,参与,结题

【科研、教学成果及获奖】

科研获奖:

1. 2018年授权发明专利“一种基于动态网络标志物的甲流疫情早期预警模型”第1);

2. 2018年获中国轻工业联合会科学技术三等奖1第1)

3. 2017年获无锡市自然科学优秀学术论文一等奖1第1)

4. 2016年获中国商业联合会科学技术三等奖1第1)。

教学获奖:

1. 2025年获评江苏省研究生优秀教学资源(课程)1项第1)

2. 2023年获校研究生教学成果等奖1第1)

3. 2017年获校本科教学成果一等奖1项;

4. 2017年获全国素质教育教研成果一等奖1第1)

5. 2015年获校本科教学成果二等奖1第1)

6. 2009年获校本科教学成果一等奖1第1)

7. 主编的《概率论与数理统计》教材2005年获校优秀教材二等奖1项。

【荣誉与奖励】

1. 2023年获评江南大学优秀教育工作者

2. 2023年获评江南大学优秀学术学位硕士学位论文指导教师;

3. 2022年获评无锡市学会系统优秀共产党员;

4. 2022年获评江南大学优秀学术学位硕士学位论文指导教师;

5. 2019年获江南大学“荣智权奖教金”;

6. 2017年获评全国素质教育先进工作者

【在读硕、博士人数】

硕士9博士3人

招生对象

数学专业 硕士,软件工程专业 博士

【以上资料更新日期】

20264



 

 

 

 

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