【综合简介】

丁彦蕊，女，民盟盟员，江南大学数学与数据科学学院教授、博士生导师。

教学方面，担任国家级、省级大学生创新项目的指导教师，指导本科生发表SCI论文，被评为第七届“江南大学我最喜爱的老师”，获江南大学本科教学成果二等奖一项。

科研方面，长期从事智能计算与复杂网络、生物信息学的研究工作。担任Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences青年编委，Computational Biomedicine编委，中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员，中国计算机学会生物信息学专业委员会通讯委员。在Neural Networks, IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics等权威期刊发表SCI论文40多篇；授权发明专利及软件著作权共20多项；主持完成2项国家自然科学基金、2项“863”重点项目子课题、多项横向课题；参与科技部“重大仪器专项”、“863”项目、国家自然基金、江苏省科技成果转化专项资金A类重点项目等项目；获得教育部科技进步奖二等奖（第三完成人）、中国石油和化学工业联合会科技进步一等奖（第二完成人）等奖项。

【工作及研究经历】：

2005.6-2010.5  江南大学信息学院

2010.6-2014.3  江南大学物联网工程学院

2012.3-2013.3  纽约大学访问学者

2014.4-2019.9  江南大学数字媒体学院

2019.10-2026.1江南大学理学院

2026.1-至今   江南大学数学与数据科学学院

【研究领域】

智能计算与复杂网络、生物信息学

【主要论著】（著作和论文）

主要论文：

[1] Liu Lingzhi, Jiang Yingying, Gu Yanbin, Zhao Shiming, Ding Yanrui*. RIT-HetGE: A residue interaction type-aware heterogeneous graph-embedding model for predicting protein thermal stability, Neural Networks, 2026, 199: 108707.

[2] Pan Shuyi¹, Liu Lingzhi¹, Yan Qunfang, Gu Yanbin, Zhao Shiming, Ding Yanrui*. Multi-view identification of key features affecting xylanase thermostability. Computational Biology and Chemistry, 2026, 124: 109072.

[3] Yan Qunfang, Pan Shuyi, Cheng Zhixing, Ding Yanrui*. RAANMF: An adaptive sequence feature representation method for predictions of protein thermostability, PPI, and drug-target interaction. Future Generation Computer Systems, 2025, 169: 107819.

[4] Cheng Zhixing, Xu Deling, Ding Dewu, Ding Yanrui*. Prediction of drug-target interactions with high-quality negative samples and a network-based deep learning framework. IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 2025, 29(3): 1567-1578.

[5] Yan Qunfang, Ding Yanrui*. Integrating reduced amino acid with language models for prediction of protein thermostability. Food Bioscience, 2025, 69: 106934.

[6] Jiang Yuxin, Yuan Xiaoyu, Zheng Shizhe, Luo Silin, Chen Haidong, Ding Yanrui*. The influence of reduced amino acid alphabets on prediction orthologous protein thermostability. Biologia, 2025, 80: 1823-1833.

[7] Cai Yupeng, Zou Xiaoyang, Ding Yanrui*. The influence of residue interaction on thermal stability of lipase based on dynamic graph embedding. Food Bioscience, 2024, 62: 105182.

[8] Gao Jiaxuan, Xiao Xiangyang, Yan Qunfang, Ding Yanrui*. CDCS-TCM: A framework based on complex network theory to analyze the causality and dynamic correlation of substances in the metabolic process of traditional Chinese medicine. Journal of Ethnopharmacology, 2024, 328, 118100.

[9] Liu Yanting, Wang Hao, Ding Yanrui*. The dynamical biomarkers in functional connectivity of Autism Spectrum Disorder based on dynamic graph embedding. Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 2024, 16(1):141-159.

[10] Wang Hao, Liu Yanting, Ding Yanrui*. Identifying diagnostic biomarkers for autism spectrum disorder from higher-order interactions using the PED Algorithm. Neuroinformatics, 2024, 22(3):285-296.

[11] Xiang Xiaoyang, Gao Jiaxuan, Ding Yanrui*. DeepPPThermo: a deep learning framework for predicting protein thermostability combining protein-level and amino acid-level features. Journal of Computational Biology, 2024, 31(2): 147-160.

[12] Yang Jing, Lu Zhengshu, Chen Xu, Xu Deling, Ding Dewu, Ding Yanrui*. GCNA-Cluster: a gene co-expression network alignment to cluster cancer patients algorithm for identifying subtypes of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2023, 20(6):3556-3566.

[13] Huang Songtao, Ding Yanrui*. Predicting binding affinity between MHC-I receptor and peptides based on molecular docking and protein-peptide interaction interface characteristics. Letters in Drug Design & Discovery. 2023, 20(12): 1982-1993.

[14] Lu Zhengshu, Chen Xu, Yang Jing, Ding Yanrui*. RSC-based differential model with correlation removal for improving multi-omics clustering. Journal of Theoretical Biology. 2023, 556: 111328.

[15] Huang Songtao, Ding Yanrui*. Identification of anticancer and anti-inflammatory drugs from drug-target interaction descriptors by machine learning. Letters in Drug Design & Discovery. 2022, 19(9): 800-810.

[16] Chen Xu, Yang Jing, Lu Zhengshu, Ding Yanrui*. A 70RNA model based on SVR and RFE for predicting the pancreatic cancer clinical prognosis. Methods, 2022, 204: 278-285.

[17] Shen Xiangpei, Ding Yanrui*. Human skeleton representation for 3D action recognition based on complex network coding and LSTM. Journal of Visual Communication and Image Representation, 2022,82:103386.

[18] Xu Deling, Wu Yanyan, Cheng Zhixing, Yang Jing, Ding Yanrui*. ACHP: a web server for predicting anticancer peptide and antihypertensive peptide. International Journal of Peptide Research and Therapeutics. 2021, 27: 1933-1944.

[19] Lü Rong, Ding Yanrui*. Community evolution and frequent subgraph patterns affect the thermostability of B. subtilis lipase A. Food Bioscience，2021, 41: 100984.

[20] Zhang Chen, Ding Yanrui*. Probing the relation between community evolution in dynamic residue interaction networks and xylanase thermostability. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2021, 18(2): 686-696.

【科研、教学项目】

科研项目：

1. 国家自然科学基金，2022.1-2025.12.

2. 国家自然科学基金，2016.1-2016.12.

3. 留学回国人员科研启动基金，2014.9-2015.9.

4. 科技部国家重大科学仪器设备开发专项项目，2013.12-2017.11.

5. 国家自然科学基金，2011.1-2013.12.

6. 国家高技术研究发展计划“863”项目，2009.1-2011.12.

7. 国家高技术研究发展计划“863”重点项目，2007.6-2010.5.

教学项目：

1. 江南大学研究生教育教学改革研究与实践课题，2019年.

2. 江南大学本科教育教学改革研究项目，2017年.

【科研、教学成果及获奖】

科研获奖：

1. 2021年度中国机械工业科学技术奖（科技进步类），排名第3.

2. 2017年获中国轻工业联合会科技进步三等奖，排名第3.

3. 2014年获中国石油和化学工业联合会科学技术奖二等奖，排名第3.

4. 2012年获教育部高等学校科学研究优秀成果奖（科学技术）二等奖，排名第2.

5. 2012年获中国商业联合会科学技术奖一等奖，排名第3.

6. 2012年获中国石油和化学工业联合会科学技术奖一等奖，排名第2.

教学获奖：

2011年获得江南大学教学成果奖二等奖，排名第2.

【荣誉与奖励】

1. 获得第七届“江南大学我最喜爱的老师”称号。

2. 评为2024年度校级优秀班主任。

【在读硕、博士人数】

硕士10人

【招生对象】

数学专业硕士；软件工程专业博士

【以上资料更新日期】

2026年4月